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핵산 농도 · 순도 계산

분광광도계 흡광도(A260)로 DNA·RNA 농도(ng/µL)와 A260/A280·A260/A230 순도를 계산합니다. ng↔pmol 몰수 변환도 지원.

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농도 계산 (A260)

측정 전 희석한 배수 (희석 안 했으면 1)

순도 비 (선택)

A280·A230을 입력하면 오염도 판정 비를 함께 계산합니다.

ng ↔ pmol 몰수 변환

길이로 분자량을 추정하는 근사치입니다 (dsDNA 650 g/mol·bp, ssDNA 330, RNA 340).

또는 아래 농도·부피로 질량을 산출하세요.

농도·부피를 둘 다 입력하면 질량(ng)이 자동 계산되어 우선 적용됩니다.

핵산 농도 · 순도 계산 소개

핵산 농도·순도 계산기는 분광광도계에서 읽은 흡광도로 DNA·RNA 농도와 오염 지표를 계산합니다. 나노드롭 같은 기기는 농도를 바로 띄워 주지만, 희석해서 측정했거나 기기가 가정한 핵산 종류가 실제 시료와 다를 때는 직접 환산해야 값이 맞습니다.

기준이 되는 것은 광로 1 cm에서 A260 = 1.0일 때의 농도입니다. 이중가닥 DNA는 약 50 ng/µL, 단일가닥 DNA와 올리고는 약 33 ng/µL, RNA는 약 40 ng/µL로 서로 다릅니다. 농도 = A260 × 계수 × 희석배수로 계산하므로, dsDNA용 설정으로 RNA를 읽으면 농도가 25%가량 낮게 나옵니다. 순도는 비율로 봅니다. A260/A280은 단백질 오염 지표로 dsDNA는 1.8, RNA는 2.0 부근이 깨끗한 값이고, A260/A230은 염·페놀·EDTA·구아니딘 오염 지표로 2.0~2.2가 이상적입니다. A260/A230이 낮으면 컬럼 세척이 덜 된 경우가 많습니다.

이 비율은 합격·불합격 판정선이 아니라 참고 기준입니다. PCR처럼 관대한 실험은 다소 낮은 순도로도 잘 돌아가지만, 시퀀싱이나 트랜스펙션은 같은 값에서도 실패할 수 있어 용도에 맞춰 판단해야 합니다. A260이 0.1 미만이거나 1.0을 크게 넘으면 기기의 선형 구간을 벗어나 값 자체가 흔들리므로 희석하거나 농축해 다시 재는 편이 낫습니다. ng↔pmol 변환은 dsDNA 650 g/mol/bp, ssDNA 330, RNA 340이라는 평균값으로 분자량을 추정한 근사치입니다. 실제 분자량은 염기 조성에 따라 달라지므로 정밀한 몰수가 필요하면 서열 기반 계산을 쓰세요.

사용 방법

  1. 핵산 종류를 고르고, 분광광도계(Nanodrop 등)에서 측정한 A260 값을 입력하세요.
  2. 흡광 계수(dsDNA 50, ssDNA 33, RNA 40, ssRNA 올리고 33)에 따라 농도(ng/µL = µg/mL)가 바로 계산됩니다. 희석했다면 희석배수를 넣으세요.
  3. A280·A230을 입력하면 A260/A280·A260/A230 순도 비와 오염 판정을 함께 보여줍니다.
  4. 아래 몰수 변환 카드에서 길이(bp 또는 nt)를 넣으면 ng↔pmol 변환과 총 몰수를 계산할 수 있어요.

자주 묻는 질문

A260 1.0이 왜 dsDNA 50 ng/µL인가요?
1 cm 경로(광로) 분광광도계에서 흡광도(A260) 1.0일 때 dsDNA는 약 50 ng/µL, ssDNA·올리고는 약 33 ng/µL, RNA는 약 40 ng/µL의 농도에 해당한다는 경험적 흡광 계수입니다. 농도 = A260 × 계수 × 희석배수로 계산합니다.
A260/A280, A260/A230 비는 어떻게 해석하나요?
A260/A280은 단백질 오염 지표로 dsDNA는 약 1.8, RNA는 약 2.0이 순수한 값입니다. A260/A230은 염·페놀·EDTA·탄수화물 오염 지표로 약 2.0~2.2가 이상적이며, 낮으면 오염을 의심합니다. 어디까지나 참고 기준이며 실험 목적에 따라 허용 범위가 다릅니다.
ng↔pmol 몰수 변환은 정확한가요?
길이로 분자량을 추정하는 근사치입니다. dsDNA 약 650 g/mol/bp, ssDNA 약 330 g/mol/nt, RNA 약 340 g/mol/nt를 사용해 MW를 구하고 pmol = 질량(ng) × 1000 ÷ MW로 계산합니다. 실제 분자량은 서열 조성에 따라 달라지므로 정밀한 작업에는 정확한 서열 기반 MW를 사용하세요.
A260 값이 음수로 나오거나 지나치게 낮게 나옵니다.
영점(블랭크)을 잘못 잡은 경우가 대부분입니다. 시료를 녹인 것과 같은 버퍼로 블랭크를 측정해야 하며, 물로 영점을 잡고 TE 버퍼에 녹인 시료를 재면 값이 어긋납니다. 측정면에 기포나 이전 시료가 남아 있어도 마찬가지입니다.

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